Начало XXI века. Мегаполис, сияющий стеклом небоскрёбов и светом неоновых вывесок, живёт в ритме импульсов и кодов. Здесь уже не отличить, где заканчивается человек и начинается машина. Импланты как норма, а подключение к нейросетям как дыхание. Всё связано, всё цифровое, всё уязвимо. Улицы кажутся безопасными, но под гладкой оболочкой города кипит жизнь, полная хаоса и невидимых угроз. Среди всего этого Девятый отдел, специальная команда, которую вызывают тогда, когда ситуация выходит за рамки обычной логики. Кибератаки, взломы сознания, цифровой терроризм это их поле битвы. Во главе Мотоко Кусанаги. Холодный ум, острое чутьё и нечто нечеловеческое в её взгляде. Она не просто солдат она граница, за которой начинается анархия.
Новое дело выводит отдел на след таинственного врага. Его не найти по камерам, не отследить по сигналам. Он существует в потоке данных, как дух сети. «Кукловод» так его называют. Он не просто нарушает законы он переписывает их. У него нет оружия, кроме кода, но этого достаточно, чтобы сломать волю и стереть личность. Люди становятся марионетками, и никто не знает, кто следующий. Расследование уводит далеко за рамки одного преступления. В каждом документе, в каждой строчке кода намёки на чужую игру, чьи ходы просчитаны заранее. Чем глубже Кусанаги и её команда копают, тем яснее становится враг не один, и угроза приходит не только извне, но и изнутри самой системы, которую они обязаны защищать.